1、职务归属不同：班主任出自教导行政管理序列，由校长引导和任免，只有班级一个层面。辅导员是出自少先队组织序列，党委托共青团直接引导少先队，辅导员由共青团选派担负，其中包括中队辅导员、大队辅导员、校外辅导员、省县(区、镇)总辅导员等多层级。
2、称呼称谓不同：老师、学生、班长、组长、班委会等，是班级管理序列的称呼辅导员、队员、大队长、中队长、小队长、中队委员会等，使少先队组织的称呼。
3、教导手腕相对有差别：班主任工作着重造就良好班风、班貌、班纪、班规，通过班会
针对性进行教导。少先队强调让队员在组织生涯和参与丰硕队运动中、在体验和感悟中自我教导。
总之辅导员在学生管理进程中主导的工作者，辅导员和班主任在班级、学生管应当中分不开的互补关系每一个辅导员时时深刻学生当中控制年级学生各项信息，懂得学生思想动态，参与学生涯动，生涯指点就会在年级管应当中施展好实质作用，同时在年级管应当中取得良好的成就。
少先队辅导员和班主任可以是一个人兼职，也可以分职。
少先队辅导员和班主任的区别
都是做学生管理的工作的。但是少先队辅导员是关于少先队工作的称号，有新队员入队，有主题队日活动，有争章达标活动等等。
班主任的话，主要是班级管理，管好卫生，纪律，学习，安全，思想道德素质等等，也包括着少先队工作，所以说有联系，又有区别的。
