农业银行公司开户有两个盾。按照中国农业银行企业网上银行管理办法规定,对公企业在农业银行开立对公账户,办理企业网上银行业务,需要提供企业经办员、复核员两名企业财务人员办理日常结算业务,经办员和复核员使用不同序列号的U盾,不能交叉使用。