处理方法有下列几种：一、协商解决。结算开始时，分包方想多要，总包方想少给，分歧较大。双方可以坐下来协商，以结算文件和定额为依据，摆事实讲道理，使意见趋于一致。

二、协调解决。如果双方协商不成，可以请主管或权威部门出面协调 ，并出示协调文件，并让双方都认可签字。

三、仲裁解决。可以请双方都认可并有资质的工程监督机构，在调阅双方提供的证据后，做出仲裁。

四、依法解决。如果分歧较大 ，以上三个途径都走不通，那只有最后走法律程序，到法院打官司，由法院判决。但这种方法耗时过长，不到迫不得已不会上法庭。