超兽武装的两部的区别是：第一个区别是：两大阵营的实力对比发生了天翻地覆，第二个区别是超兽战队阻止冥王复活，变成了对抗暗中挑动战争的鬼王鬼谷，第三个区别是两大阵营开始联手对抗鬼王，最终也导致了鬼王鬼谷在最后一刻被击杀。