地铁16号线途经秦淮区、雨花台区和江宁区，线路西起梅钢站，先后经板桥新城、岱山片区、两桥片区、软件谷、南部新城，东至红花机场站。共设置16个站点，分别是红花机场站、大明路站、玉兰路站、花神庙站、软件大道站、铁心桥站、银杏山庄站、大定坊站、梅苑南路站、梅欣路站、西善花苑站、华兴大街站、新城大街站、板桥东站、板桥南站、梅钢站。