马来群岛纬度范围大约在20°N至10°S之间，赤道横穿马来群岛。因此，马来群岛大部分地区终年受赤道低气压带控制，盛行上升气流，降水丰富，形成终年高温多雨的热带雨林气候。菲律宾所在的部分，属于热带季风气候，终年高温，分明显的干湿季节。