母猪第三次配不上要查原因:1.母猪是否发情正常，母猪发情时表现外阴红肿，外翻表现粉红潮红，有粘液流出，粘液拉成丝时，有静立反应时可配种。

2、查情时注意有没有子宫炎，如果有子宫炎要及时治疗好才可以配种。

3、要正确输精，不要让精液倒流。