《天空侵犯》讲述的是一群人意外进入异常空间的故事。在这个异常空间里，只有高楼大厦以及将高楼连接起来的吊桥而已，即使是想要回到地面，通往地面的道路也被完全封锁了。而在这里，有着一群带着面具的人，并会到处狩猎没有带上面具的人。女高中生「本城游理」不知何故进入了这个空间， 在联络了哥哥「本城理火」以后，便开始踏上与哥哥团聚的旅途。