法人代表证书的正副本是具有同等法律效力的，在实质上是没有区别的。

正副本具有同等的法律效力，只是为了方便使用才做两个的。正本太大，到处拿不方便，而且正本需要在经营场所悬挂的，一般办其他什么事，用副本，小，方便携带。副本为折叠式，主要用于事业单位在开展社会服务活动中对外出示，以证明其合法身份，或用于向有关部门办理各种手续。事业单位可以根据业务需要向登记管理机关申请核发若干份证书副本。