毕业论文提交系统以后是不可以修改的。毕业论文在提交系统之前是可以和导师进行商量，也可以按照导师的要求进行修改，但是一旦将毕业论文提交到系统以后，那么就算毕业论文定稿了，不能再进行修改了，因为系统是最后核定的，不能修改。