负5焦耳的功比3焦耳的功大。

做功的大小是能量转移或转化的量度，功是标量，有正负之分，正功表示动力对物体做功，负功表示阻力对物体做功。

功的正负表示能量转换的方向不同，外力对物体做正功，对应形式的能量增加，外力对物体做负功，对应形式的能量减小。做负5焦耳的功，是指通过做功，物体对应形式的能减少五焦耳而做3焦耳的功，是指通过做功使物体对应形式的能增加3焦耳。

通过以上分析可知，做负5焦耳的功比做3焦耳的功大。