由生产单位负责。

重大事故隐患应该由部门单位主要负责人来负责。这是因为按照企业安全生产的法律规定要求，企业负责人应当对企业安全生产经营负全面管理责任，同样对企业员工的生命财产安全也负全面责任，由于对安全管理疏忽而造成重大事故隐患，应该及时消除，保障安全生产。