两者区别如下：

“三线一单”，指的是生态保护红线、环境质量底线、资源利用上线和环境准入清单。建立以“三线一单”为核心的生态环境分区管控体系，是推进生态环境保护精细化管理、强化国土空间环境管控、推进绿色发展高质量发展的一项重要工作。

三区三线，“三区”是指城镇空间、农业空间、生态空间三种类型的国土空间。“三线”分别对应在城镇空间、农业空间、生态空间划定的城镇开发边界、永久基本农田、生态保护红线三条控制线。