科莫多巨蜥是已知存在的体型最大的蜥蜴，平均体长2—3米平均体重：雄性79—91千克，雌性68—73千克，最长3.13米重166千克（包括未消化食物在内），圈养的通常比野外的重。

它的尾巴和身体几乎一样长，四肢粗细宛如成人手臂，头和排球大小差不多。幼崽皮肤颜色是绿色、黄色和黑色。成年的巨蜥全身呈黑褐色。