两者区别为来源不同。柴桂来源于樟科樟属植物川桂，以树皮入药。别名 桂皮香。柴胡来源于伞形科植物柴胡或狭叶柴胡的干燥根。柴胡根有不规则的分枝，棕褐色或棕黑色茎直立丛生，叶互生，广线状披针形，全缘复伞形花序，小花黄色，双悬果长圆形。