区别一、释义不同

水货：在某国家或地区未经原生产厂家指定销售代理的产品。

专柜：商店内以一项或几项独特商品为特色的柜台或售货部。

区别二、引证出处不同

水货：现代汉语词典。

专柜：马季《礼仪之邦》：“那里开辟了 中华人民共和国 商品专柜， 四川 的竹器， 山东 的草制品， 汕头 的抽纱， 湖南 的湘绣，质地优良，品种齐全。”