二者都是指美好年华的意思。芳华正茂着重强调花香般的美好年华风华正茂主要强调风采和才华的美好时候。

所谓芳华正茂，就是形容在如芬芳的花一样的年华正是最灿烂的季节，也可以认为是拥有青春，才华，正是开始走向人生巅峰的意思。一般形容女生吧。男生的话应该是风华正茂吧。