单位公章和部门公章，不同之处在于所代表的权力不一样，部门公章，仅限部门，不能代表单位。

使用的范围不一样，部门公章通常在单位内部使用，少数行使公共职能的部门，例如出入境管理部门，车管所，运管处等，也可以对外使用。

通常，单位公章比部门公章，直径要大些。