支付宝12306和12306app区别不太大，都是官方软件，只是功能有所差异。

主要的区别就是12306app是官方关官方直接的app软件。而支付宝上的12366也是官方的，但是它是通过通过支付宝进入小程序进去的。总体来说没有太大区别，只不过是一个直接打开，另一个是通过第三方软件进入的。