电视剧坏家伙们的全盛时代大结局是：李正文最终贝证实是被人陷害的，幕后主使就是那个检察官吴在元，全是他因为妻子意外被杀害产生了报复心理之后一手策划的，杀了人之后以李正文有精神分裂症（实则给他吃了药物）为由，嫁祸给了李正文。

最后该坐牢的继续坐牢，吴九卓答应的给他们的减刑也不算数，疯狗刑警吴九卓自己也因为曾陷害李正文入狱而进了监狱，检察官吴在元也被抓。