采收茎叶宜在夏季孕穗而未抽穗时，芥穗宜于秋季种子50%成熟、50%还在开花时采收。选晴天露水干后，用镰刀割下全株阴干，即为全荆摘取花穗晾干，称荆芥穗其余的地上部分由茎基部收割、晾干，即为荆芥梗在收获药材时，需选留种株，待种子充分成熟后再收割，放在半阴半阳处晾干，干后脱粒，除去茎叶等杂质后收藏。