运营分析控制的方法有因素分析法、对比分析法、趋势分析法。

运营分析控制：要求企业建立运营情况分析制度，经理层应当综合运用生产、购销、投资、筹资、财务等方面的信息，通过因素分析、对比分析、趋势分析等方法，定期开展运营情况分析，发现存在的问题，及时查明原因并加以改进。

企业内部控制措施包括：不相容职务分离控制授权审批控制会计系统控制财产保护控制预算控制运营分析控制绩效考评控制。