香蕉心腐病属全株性病害。病株叶片出现褪绿黄色条纹，呈典型花叶斑驳状，尤以近顶部1—2片叶最明显，叶脉稍肿凸。

花器受害呈现斑驳症状。假茎内侧初现黄褐色水渍状小点，后扩大并连合成黑褐色坏死条纹或斑块。

早发病幼株矮缩甚至死亡成株感病则生长较弱，多不能结果，即使结实也难长成正常蕉果。当病害进一步发展时，心叶和假茎内的部分组织出现水渍状病区，以后坏死，变黑褐色腐烂。