赤菜芽和海石花的区别如下：

1、性质不同

赤菜芽和海石花的外观虽然有些相似，但两者是性质不同的两种存在，赤菜芽是一种生长在海洋中的藻类生物，它属于石花菜科，而海石花则是动物脊突苔虫死亡以后的干燥，骨骼在海洋中经常时间冲刷形成的一种物质。

2、形态不同

赤菜芽和海石花的形态也有明显不同，赤菜芽是一种藻类生物，它的藻体为紫红色或者棕红色，这种生物扁平直立以重生为主，而且有羽状的分支，海石花这种生物形态类似于珊瑚，多为不规则的块状。