菏泽职业学院在牡丹区长城路999号，西面是新牡丹路，前几年因为学院二期和三期建设没有完工，有个别系租的菏泽市职教中心的教学设施，随着学院基础建设逐步完工，目前菏泽职业学院没有分校区，都在一个校区学习。