异特龙的眼睛上方拥有一对角冠，由延伸的泪骨所构成，角冠的形状与大小随着个体的不同而不同。鼻骨的上方也有一对低矮的棱脊，并沿着鼻骨，连接到眼睛上的角冠。这些角冠可能覆盖着角质，并具有不同的功能，例如，替眼睛遮蔽阳光等。

异特龙的头颅骨是由个别的骨头所组成，而骨头之间有可活动关节。它的头颅骨后上方也有一个棱脊，可供肌肉附着，这个特征也可见于暴龙科动物。异特龙脑壳顶部较薄，可能为促进脑部的体温调节。