国家铁路总公司下属有十多个研究所，分别是：机车车辆研究所、铁道建筑研究所、通信信号研究所、运输及经济研究所、金属及化学研究所、电子计算技术研究所、节能环保劳卫研究所、标准计量研究所、科学技术信息研究所、基础设施检测研究所。另外也有个别针对某个铁路项目设立的研究所，但是只针对项目服务，往往是项目结束就撤消了。