全国三甲医院最强的学科有很多，因为各个地方的三甲医院研究方向不一样，最强学科也就不一样，只要是国家211工程专业实力都是最强的，例如上海的三甲医院最强的是肝胆外科，北京的三甲医院最强的是心血管内科，四川的三甲医院最强的是口腔医学。