污水中含有大量的氨氮离子，这些氨氮离子是水中的营养素，会导致水体富营养化，消耗水中的氧气，对水中的生物有很大的危害性。所以在污水处理时，降低氨氮的指标就成了关键，而次氯酸钠在其中就能发挥不错的作用。

因为次氯酸钠是氧化剂常用作强氧化剂，用作漂白剂、氧化剂及水净化剂，广泛用于造纸、纺织、轻工业行业，在用作水处理时能将氨氮氧化成硝酸盐，但一般废水处理可采用活性污泥法将氨氮氧化成硝酸盐，不过使用之后会有残余的有效氯，影响水中的COD。所以每次在使用时都要计算好用量，以免为后续的工艺带来负面影响。