最常见的清理鱼缸粪便的鱼是清道夫、鼠鱼、胭脂鱼，其中清道夫价格便宜，可以和其他鱼混养，比较容易存活，胭脂鱼在水中部和底部活动，对水中的含氧量要求较高，鼠鱼喜欢吸附在缸壁和叶子上，对水环境要求也较高。

除此之外，黑壳虾和一些螺类也有清理粪便的能力。

想要彻底保持水体的清澈，还是需要微生物将这些粪便分解想要清理鱼缸里的粪便。