电子油门加速器的弊端主要是使车辆操作难度变大、车辆油耗增加和不方便驾驶。

车辆操作难度变大：

手动挡的车型在加装电子油门加速器后，油门变的更加灵敏。所以在车辆起步或者换挡时，油离配合就会更难，可能会出现加油不走或者车辆憋死的情况。

车辆油耗增加：

由于油门更加敏感，在车辆行驶中或多或少就会使油耗有所增加。但是油耗增大程度并不算特别严重，一般是可以接受的。

不方便驾驶：