一般情况下按照医院的奖罚分配制度，科室二次分配，科室主任有权力根据本科室各工作人员的工作效应决定分配奖金，如果员工经常迟到军退，不按时完成岗位核定的工作任务，发生差错事故，给科室造成影响的，科主任可根据相关制度扣罚奖金的。