潜伏的故事主要是解放战争时期的故事。

潜伏的故事开始于抗日战争末期。从主人公余则成由军统特务转变成我党地下工作者后，在天津潜伏的故事。余则成和翠萍在潜伏中多次逢凶化吉，完成任务，为天津的解放做出了重大贡献。最后余则成到台湾继续和晚秋执行潜伏任务。