广西高等体育专科学校毕业生有挂科的是会影响毕业的。因为，按教育部有关规定，高等学校毕业生，有挂科的是不能按时顺利毕业的，不能及时领到毕业证的，必须延期至所挂学科的科目补考及格后方能准予毕业。所以广西高等体育专科学校按规定也是不能挂科，否则不能按时毕业，从而影响就业。