纯化水机组运行的原理是利用活性炭大量的微孔和极强的物理吸附能力，有效的吸附水中杂质，尤其是有机物和微生物。

活性炭表面形成的含氧催化氧化和化学吸附的功能，可以去除一部分水中的金属离子。