耐水性马克笔属于水性非油性。耐水性的墨水因为含有油精成份，故味道比较刺激，而且较容易挥发。

耐水性马克笔颜色鲜艳，笔触清晰，多次覆盖后色彩变浑浊，但是干了之后不易变色，稳固性非常好。如果单纯的上色，耐水性马克笔效果更好。耐水性马克笔通常适合较紧密的卡纸或铜版纸上作画，用来画人物画比较好。