国企工程项目亏损由项目经理承担责任。现在国企央企都实行项目经理承包责任制，在工程项目准备阶段，国企及央企跟项目经理签订工程项目承包责任状。这样项目经理会精益求精的抓工程质量工程进度，项目经理认真负责的履行自己的职责，争取扭亏为盈。