上海户籍身份证开头不是99，是31，99身份证号码开头的不一定是外地户口。我国公民身份证号码是由公民出生地区的公安机关根据居民身份证号码的规定规律编制的，终身不变，就是公民户籍迁移，身份证号码不会更换，如果公民原来不是上海户籍，那么他的身份证号码开头肯定不是31，可能是99，后来户籍迁移落户至上海，他的身份证号码还是原号码。