乌丸莲耶是黑衣组织的BOSS在999集经过工藤优作推测出。

剧情中，柯南是工藤新一的身份有暴露的危险，工藤优作回到日本来摆平了表面上的舆论风波。而这次，工藤优作与赤井秀一经过了沟通，得知了羽田浩司案的死亡信息，并且最终推测出指向的是黑衣组织的boss乌丸莲耶。