两者区别在于，工程施工中的保留金是保证金中的一部分。保留金是建设单位为保证工程项目施工质量而向施工单位收取，或在工程尾款中扣除的质量保证金。

如果在预订的考察期内不发生质量问题的，建设单位向施工单位返还该质保金。

而保证金除了包含质保金以外，还包括工程施工能力方面的履约保证金等，因此工程保留金在保证金的范畴之内。这就是两者的区别