一般来说，药材发霉后，可根据具体情况，分别采用洗、涮、晾、晒、烘、烤等方法处理。

有微霉者，可放在太阳下曝晒，趁热簸筛，或用手搓，以扬弃或者搓除霉丝，再行晒干。

量小者，可用洁净的布蘸开水擦拭药性较稳定，能沾水的药材则用水洗：不能用水洗的药材，先晒干，后行刷霉不便于刷霉者可用布袋装好糠头，将药材放入其中撞击。某些药材，如乌梅、山茱萸，可用醋洗后干燥。若逢梅雨季节或久雨不晴者，霉药无法进行暴晒，则可用火烤(低温干燥)，量小而贵重者，可用恒温箱烤。