但愿有你的意思就是说，对方非常的欣赏你非常对你有好感，特别喜欢你，同时也非常希望能够最终走到一起。

你比如说某男孩儿在谈恋爱的时候对女孩儿说，但愿以后的日子，每一天都有你的陪伴。但愿在我的世界里，每一秒钟都有你。基本上大致就是这个意思。