根据缩聚反应所形成共价键的种类，可将COFs分为: 硼酸类、三嗪类、亚胺类、苯腙类、酮烯胺类、聚酰亚胺类、酞菁类和卟啉类。其中连接COFs的共价键赋予了COFs耐高温的特性，但COFs的不同共价键的其他化学稳定性则有所不同。对于硼酸类COFs，虽然其B-O共价键中的硼空p轨道与相邻氧原子和苯环上的Π电子共轭，但它仍然容易受到水等适度亲核试剂的攻击，造成B-O共价键的水解，进而导致其孔道坍塌。