二者的主要区别如下：

第一、 棕榈油和脂肪酸钠的化学分类不一样：其中棕榈油是属于脂肪酸的混合物而脂肪酸钠是化合物而非混合物。

第二、 棕榈油和脂肪酸钠的物理性质也不一样：其中棕榈油常温下是液态，而脂肪酸钠常温下是固态。

第三、 棕榈油和脂肪酸钠的性能用途也不一样：其中棕榈油可用于餐饮、食品和油脂化工业而脂肪酸钠则是用于棉、麻、毛、丝绸等织物及日常杂物的洗涤或合成洗涤剂。