1、含义不同

制度泛指以规则或运作模式，规范个体行动的一种社会结构。

通知是向特定受文对象告知或转达有关事项或文件，让对象知道或执行的公文。

2、出处不同

制度出自 《易·节》：“天地节，而四时成。节以制度，不伤财，不害民。”

通知出自《汉书·平帝纪》：徵天下通知逸经、古记、天文、历算……至者数千人。