珊瑚礁配底砂用珊瑚砂最好。因为珊瑚砂在水族箱中具有“生化过滤”的功能。

普通的砂子由于太细小之故，其砂粒本身缺少毛细孔隙，无法培养出大量“硝化细菌”，而使得水族箱中的有毒物质无法完全分解，对水族动物而言是有害的，因此应使用较大的珊瑚砂为底砂。

在水族箱内放置沙层，正常运转一段时间后，就建立了沙砾表层的有氧区、中层的微氧区，对于鱼类的饲养是非常有益的。