1、生长环境不同。
黄花鱼生于东海中，广泛分布于北起黄海南部，经东海、台湾海峡，南至南海雷州半岛以东。
黄姑鱼是近海暖温性中下层经济鱼类，分布于中国沿海、朝鲜、日本南部。
2、体型不同。
黄花鱼，体长约30余厘米，近长方形而侧扁，头大而侧扁，吻圆钝。上、下颌相等，唇薄上颌骨能伸缩。
黄姑鱼，长一般为20~25厘米，呈长椭圆形，侧扁，头中大，吻短钝。下颌稍短于上颌。两颌齿细小，上颌外行齿及下颌内侧齿较大。
3、颜色不同。
黄花鱼，体背侧灰黄色，下侧金黄色背鳍及尾鳍灰黄色，胸鳍、腹鳍及臀鳍为黄色。 多活动于海水中下层，有洄游习性。
黄姑鱼，体灰橙色，体侧有许多灰黑色波状条纹，斜向前下方，在侧线上下方不连续，腹面银白色。背鳍灰橙色，每鳍条基部有1黑色小点。胸鳍、腹鳍及臀鳍淡橙色，基部均带红色。尾鳍橙色
黄婆鱼和黄鱼的区别
黄鱼与黄花鱼是同一种鱼类。黄鱼与黄姑鱼的区别如下：
1、两者在生物学不同
黄鱼，属鱼纲、石首鱼科。由于鱼头内部有两颗坚硬的石头，故名“石首鱼“，而黄姑鱼，属硬骨鱼纲、 鲈形目、 石首鱼科、黄姑鱼属。
2、体形特征不同
黄花鱼分为大黄鱼和小黄鱼，两者形态相似。特征为：大黄鱼尾柄细长，鳞片较小，体长40～50厘米，椎骨25～27枚小黄鱼尾柄较短，鳞片较大，体长20厘米左右，椎骨28～30枚。
