主要工作原理是通过内置变压器将输出的电压变成脉冲高压，一般在2000伏左右将电流变成符合安全标准的36毫安以下的电流，一般在20毫安左右。并从灭鼠器中引出两根导线，其工作原理与警察使用的电警棍相似。

只要老鼠同时碰到这两根线，就会被瞬间高压击昏。由于它的电流很小，所以对除啮齿类动物以外的其它生物都比较安全。原则上，这两根导线可以拉一公里长，换句形象的话说，就是将一根一公里长的电警棍来对付老鼠。 安装电子灭鼠器的方法正确与否很重要。