工程竣工结算是指业主与施工方的结算，一般是通过造价工程师对其金额进行审计，而财务竣工决算主要是业主实际为工程支出的全部费用，两者主要区别是财务竣工决算包括竣工结算金额但不限于竣工结算金额，财务竣工决算还包括待摊投资（如利息、设计费等）。