阳光长跑不会影响毕业。影响毕业证书的一般是在在校期间有重大违纪行为导致开除学籍的，比如作弊等。另外在毕业前所获学分达不到学校规定最低学分时，毕业时拿不到学位证，但是可以拿到毕业证。